مخفف BLAST
Basic Local Alignment Search Tool
11
با این نرمافزار میتوان توالی اسیدهای آمینه در پروتئینها یا توالی نوکلئوتیدها را در DNA را با هم مقایسه کرد. این نرمافزار به پژوهشگر اجازه میدهد تا یک توالی را با توالی دیگر یا توالی که در بانک اطلاعاتی وجود دارد، مقایسه کند. شناسایی توالیهای موجود در بانک اطلاعاتی که بیشترین شباهت را با توالی مورد نظر دارد از دیگر قابلیتهای این نرمافزار است. بر حسب نوع توالی انواع مختلفی از بلاست امکانپذیر است. مثلاً اگر یک ژن ناشناخته در موش که قبلاً اطلاعاتی از آن در اختیار نبوده، باید بررسی شود، یک پژوهشگر ترجیح میدهد این توالی را با ژنوم انسان بلاست کند. این نرمافزار در NIH (مؤسسه ملی بهداشت آمریکا) طراحی شد. بلاست یکی از پرکاربردترین نرمافزارها در بیوانفورماتیک است که با سرعت مطلوب مقایسه مورد نظر را انجام میدهد. سرعت زمانی اهمیت خود را نشان میدهد که با ژنوم کامل روبرو باشیم. پیش از طراحی این نرمافزار مقایسه توالیها بسیار وقت گیر بود.