مخفف BLAST
Basic Local Alignment Search Tool
12
بلاست نام یک نرمافزار کاربردی در علوم سلولی و مولکولی و ژنتیک است که ابزار پایهای برای جستجوی برهمنهیهای موضعی است. این ابزار قسمتی از مجموعهٔ اطلاعات کیفی مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری است.
با این نرمافزار میتوان توالی اسیدهای آمینه در پروتئینها یا توالی نوکلئوتیدها را در DNA را با هم مقایسه کرد. این نرمافزار به پژوهشگر اجازه میدهد تا یک توالی را با توالی دیگر یا توالی که در بانک اطلاعاتی وجود دارد، مقایسه کند. شناسایی توالیهای موجود در بانک اطلاعاتی که بیشترین شباهت را با توالی مورد نظر دارد از دیگر قابلیتهای این نرمافزار است. بر حسب نوع توالی انواع مختلفی از بلاست امکانپذیر است. مثلاً اگر یک ژن ناشناخته در موش که قبلاً اطلاعاتی از آن در اختیار نبوده، باید بررسی شود، یک پژوهشگر ترجیح میدهد این توالی را با ژنوم انسان بلاست کند. این نرمافزار در NIH (مؤسسه ملی بهداشت آمریکا) طراحی شد. بلاست یکی از پرکاربردترین نرمافزارها در بیوانفورماتیک است که با سرعت مطلوب مقایسه مورد نظر را انجام میدهد. سرعت زمانی اهمیت خود را نشان میدهد که با ژنوم کامل روبرو باشیم. پیش از طراحی این نرمافزار مقایسه توالیها بسیار وقت گیر بود.
ارسال نظربا این نرمافزار میتوان توالی اسیدهای آمینه در پروتئینها یا توالی نوکلئوتیدها را در DNA را با هم مقایسه کرد. این نرمافزار به پژوهشگر اجازه میدهد تا یک توالی را با توالی دیگر یا توالی که در بانک اطلاعاتی وجود دارد، مقایسه کند. شناسایی توالیهای موجود در بانک اطلاعاتی که بیشترین شباهت را با توالی مورد نظر دارد از دیگر قابلیتهای این نرمافزار است. بر حسب نوع توالی انواع مختلفی از بلاست امکانپذیر است. مثلاً اگر یک ژن ناشناخته در موش که قبلاً اطلاعاتی از آن در اختیار نبوده، باید بررسی شود، یک پژوهشگر ترجیح میدهد این توالی را با ژنوم انسان بلاست کند. این نرمافزار در NIH (مؤسسه ملی بهداشت آمریکا) طراحی شد. بلاست یکی از پرکاربردترین نرمافزارها در بیوانفورماتیک است که با سرعت مطلوب مقایسه مورد نظر را انجام میدهد. سرعت زمانی اهمیت خود را نشان میدهد که با ژنوم کامل روبرو باشیم. پیش از طراحی این نرمافزار مقایسه توالیها بسیار وقت گیر بود.