این پژوهشگاه اولین سازمان دولتی در ایران است که به شبکه اینترنت متصل شد. همچنین سالها بعد پروژهٔ ثبت دامنههای .ir را با همت سیاوش شهشهانی راهاندازی کرد.
این موسسه دارای چند پژوهشکده است:
پژوهشکده ریاضیات
پژوهشکده فیزیک
پژوهشکده علوم کامپیوتر
پژوهشکده علوم شناختی
پژوهشکده علوم نانو
پژوهشکده فلسفه تحلیلی
پژوهشکده نجوم
پژوهشکده ذرات و شتابگرها
آزمایشگاه علوم محاسباتی
گروه رایانش تورین (grid computing)
